水田淹水期要注意氮肥的调整，不能使用过多的硝态氮，可以通过增加铵态氮和还原态氮的使用来避免因为水分过多而导致的氮素流失。
但氮肥种类的不同也会对稻谷的产量和品质带来影响。比如氨基酸肥能够增加稻谷的蛋白质含量，而尿素则易于挥发，使得氮肥利用率降低。而在淹水期，硝酸铵肥的利用率也会下降，因为土壤中的硝态氮会被还原为氨态氮或甲烷等有毒气体挥发。
因此，在水田淹水期，不适合大量使用硝态氮肥，而铵态氮肥和还原态氮肥则可以少用一些，以免造成氮肥的浪费和污染。
在实际调整种植的时候，可以施用含有一定比例铵态氮和还原态氮的复合肥，以满足水稻的氮肥需求，并减少因为水分过多产生的氮素流失。
